• В 1951 году приказом городского отдела здравоохранения г.Алматы №260 на базе онкологического отделения городской больницы №1 был основан Городской онкологический диспансер. Первым главным врачом диспансера была назначена Лобанова Нина Георгиевна (1951-1963 гг.).
• В 1963 году произошло объединение Республиканского и городского онкологических диспансеров в единый городской онкологический диспансер, который разместился в новом 3-этажном здании по улице Утепова, дом 3.
• В 1982 году в диспансере были открыты торакальное и химиотерапевтическое отделения.
• В 2007 году в составе патоморфологической лаборатории был открыт кабинет имуногистохимической диагностики. Сегодня это иммунногистохимическая лаборатория с современным оборудованием и высококлассными специалистами-лаборантами.
• В 2009 году было организовано отделение лучевой диагностики и лучевой терапии, благодаря чему появилась возможность применять высокотехнологическое оборудование для проведения внутриполостной и внутритканевой лучевой терапии с источником ионизирующего излучения высокой мощности дозы на гамма терапевтическом аппарате «Gamma Med plus».
• В 2015 году в отделении лучевой диагностики и лучевой терапии впервые в Казахстане стала применяться инновационная технология – интраоперационная лучевая терапия.
• В апреле 2019 года введен в эксплуатацию новый радиологический корпус, в котором был установлен самый современный в стране линейный ускоритель «TrueBeam STX».
• В июне 2018 года временно передислоцирован на базу городской клинической больницы №4 города Алматы по адресу улица Папанина, дом 220 литер А.

Сегодня Алматинский онкологический центр – это современное лечебное учреждение, в котором оказывают специализированную медицинскую помощь онкологическим пациентам с использованием инновационных методов и достижений мировой медицины.

В Центре работают более 600 сотрудников, в том числе 2 доктора и 8 кандидатов медицинских наук, 3 доктора PhD, 10 магистров здравоохранения, более 70% медицинских работников имеют квалификационные категории.

По итогам 2019 и 2020 годов Алматинский онкологический центр признан лучшим в рейтинге онкологических организаций Казахстана.